扁桃体切除术是门诊手术，除非孩子太小的话，一次就可以完成，恢复时间为10到14天。扁桃体切除术一度使用得很普遍，因为切除之后就不患扁桃体炎了。但是切除扁桃体只能中度地减少咽炎的频率和严重性，并不能彻底地防止咽炎的发生，切除扁桃体会影响到儿童的免疫防御，因此才有了上述的比较严格的条件，不满足这些条件的话，通常不进行手术切除，就是因为要平衡利弊。 尽管如此，现在切除扁桃体的孩子中有很多不符合条件。美国15岁以下儿童每年超过53万例扁桃体切除术。这种手术安全系数很高，但有一定的风险。尤其是出血和感染，术后出血的发病率为2%到4%，因为出血、气管堵塞或麻药合并症而死亡的比例为1：15000。 根据统计，切除扁桃体之后，做手术的孩子和没有切除扁桃体的孩子相比，每年患咽炎的天数会少5天。这种区别在1到2年后消失，原因是因为两组孩子患咽炎的天数都大幅度下降，这是国外的资料。中国的孩子因为种种原因，患咽炎的次数高，也许会有更多的获益。另外一点，在国外切除扁桃体是全身麻醉，因此要承担全麻的风险，国内则局麻为主，虽然让孩子感觉不舒服，但减少了一定的风险，因此中国做扁桃体切除术比国外利多了一些。
