《藏海传2》的剧情紧接第一季，藏海虽已在一定程度上揭露了部分阴谋，但血海深仇尚未彻底得报，朝堂局势也愈发错综复杂…
藏海成功进入平津侯府成为幕僚后，凭借着自己的智谋与谨慎，逐渐取得了庄芦隐一定程度的信任。然而，平静的侯府实则暗流涌动。庄芦隐的长子庄之乾，表面上是个玩世不恭的公子哥，实则心机深沉，他察觉到藏海的到来似乎别有用心，于是暗中调查藏海的身世，一场无声的较量在侯府内悄然展开。
与此同时，大雍国边境战事吃紧。邻国冬夏国借口大雍国在边境的一次资源勘探活动侵犯了他们的领土，派大军压境。朝堂之上，主和派与主战派争论不休，庄芦隐作为朝中重臣，在这场争论中扮演着关键角色。藏海深知，这是一个打乱对手节奏、进一步揭露阴谋的好机会。他巧妙地利用各方势力在战和问题上的分歧，散布对自己有利的消息，引导舆论朝着对自己复仇计划有利的方向发展。
在一次侯府的宴会上，庄之乾故意安排一位擅长歌舞的女子接近藏海，试图从他口中套出秘密。藏海心中警觉，却不动声色，将计就计，故意透露一些似真似假的信息，让庄之乾陷入迷惑。而这位女子，其实是藏海在暗荼组织中的一位旧相识，两人暗中配合，不仅成功骗过了庄之乾，还获取了一些关于庄芦隐与冬夏国暗中勾结的线索。
随着调查的深入，藏海发现当年的灭门惨案背后，除了庄芦隐，还涉及到朝中多位高官，甚至与当今圣上的某些决策有着千丝万缕的联系。而此刻，大雍国的国库空虚，军队补给不足，在与冬夏国的战争中逐渐处于劣势。藏海意识到，要想真正报仇雪恨，不仅要解决庄芦隐个人，还需要从根本上改变大雍国的朝堂局势，整顿吏治，增强国力。
于是，藏海联合朝中一些正义之士，包括曾经在钦天监的旧友，以及在江湖中结识的豪杰，共同制定了一个大胆的计划。他们一方面搜集庄芦隐等人叛国通敌、贪污腐败的证据，另一方面，通过巧妙的布局，让冬夏国的军队陷入了一个预设的陷阱，暂时缓解了边境的危机。
在这个过程中，藏海与自己心爱的女子之间的感情也经历了考验。女子担心藏海在复仇的道路上越陷越深，不惜牺牲自己的生命，而藏海则在爱情与仇恨之间艰难抉择。最终，他明白只有实现了真正的正义，才能给爱人一个安稳的未来，也才能告慰家人的在天之灵。
当所有的证据准备齐全，藏海在朝堂之上，当着文武百官和圣上的面，揭露了庄芦隐等人的罪行。庄芦隐狗急跳墙，试图发动叛乱，但早被藏海等人提前识破并镇压。随着庄芦隐的倒台，背后的黑暗势力也逐渐土崩瓦解……[doge][doge]
